《内蒙古医科大学学报》是由内蒙古医科大学主管主办的医药卫生综合性学术期刊，于1959年创刊，系双月刊，国内外公开发行,《内蒙古医科大学学报》现为中国科技论文统计源期刊(中国科技论文核心期刊)（2008、2010、2011版科技论文统计源期刊目录期刊），曾获Caj-cd规范获奖期刊奖，并被《中国科学引文数据库》、《中文生物医学期刊数据库》、《中国学术期刊（光盘版）数据库》、《中国学术期刊综合评价数据库》、 《中文科技期刊数据库》、《中文科技资料目录》、《全国报刊索引》、《中国药学文摘》和《中国医学文摘》（7个分册）等国内外大型数据库收录。

《内蒙古医科大学学报》主要刊载基础医学、临床医学、民族医药学、中医中药学、预防医学等领域的最新研究成果、进展及科研动态。开辟有论著（基础医学、临床医学、预防医学）、蒙医药论坛、技术与方法、经验交流、短篇、综述等栏目。